用代码模拟红细胞在显微镜下的形态
Simulated red blood cells and microscopy

读博期间,我曾参与模拟红细胞(RBCs)在微流控芯片中的流动,旨在优化检测循环肿瘤细胞的设备。当时,我们的耗散粒子动力学(DPD)模拟结果与真实实验视频存在偏差。多年后,我决定重新挑战这一难题:结合边界积分法(BIM)求解斯托克斯流,并构建红细胞复杂的膜动力学模型。我成功复现了著名的 SDE 序列(stomatocyte-discocyte-echinocyte),即红细胞在不同化学环境下的形态变化。更关键的是,我建立了一个微分干涉对比(DIC)显微镜模型,将完美的数值表面转化为带有真实光学伪影的图像。最终,通过模拟剪切流中的“坦克 tread”(tank-treading)现象,我生成了与实验视频高度一致的 DIC 显微图像。这不仅验证了物理模型,也为未来利用机器学习从实验视频中反推红细胞形态奠定了基础。
在理想世界里,我们会从视频中重建表面,但这绝非易事;不如反其道而行之:先构建完美的表面,再模拟显微镜的成像过程。