Google DeepMind、ヒトゲノムの全90億塩基置換の影響を予測する「AlphaGenome Atlas」を公開
AlphaGenome Atlas predictive map of every DNA letter change in the human genome
Google DeepMindは、ヒトゲノムにおける約90億種類すべての一塩基変異（SNV）が分子生物学に及ぼす影響を事前計算した「AlphaGenome Atlas」を公開した。1ペタバイト規模のこのデータセットは、AlphaFold Databaseの30倍以上の大きさで、研究者は無料のウェブポータルやAPIを通じて、各変異の分子効果予測、影響度を示すAVIスコア、その根拠となる特徴量帰属、そして2,500以上のDNA配列モチーフを閲覧できる。既に共同研究では、未診断の希少疾患の原因変異の特定や、UKバイオバンクのデータ解析による非コード領域の関連変異の発見に成功しており、遺伝子研究の加速が期待される。
DNAは生命の言語であり、それを習得することは、生物学の理解と疾患治療の変革につながる大きな挑戦です。
- Terr_
Deus Exゲームシリーズは、手間をかけて発見できるゲーム内の伝承で知られていますが、DXHR（2011年）からのこのメールが関連していると思います：
> 私たちはVersaLifeの新しいChaos Model Genomatrixに取り組んでいます。これはフラクタル数学を遺伝子変異の研究に応用しようとするものです。本質的に、私たちはミトコンドリアのデータベースに保存されている過去の変異を使って人類の進化の未来を予測しようとしています（ミトコンドリアは祖先イブから母親を通して途切れることなく受け継がれ、私たちの共通の過去の正確で普遍的なロードマップを与えてくれます）。
> 問題は…あなたが送ってくれたサンプルが、私たちの未来の進化モデルの一つに適合していることです。私たちは、遺伝子のカーブを1歩、あるいは2歩先取りしている人物について話しているのです。医学だけでも、これが何を意味するか分かりますか？あなたは生きていて呼吸しているノーベル賞を手にしているのです！
（メーガン・リードのコンピュータ、プロローグにて。）
- BigTTYGothGF
一方で、誰かがウイルスで同等の問題について実験を行いました：https://www.science.org/content/blog-post/mutate-em-all-and-...
- jenders
その抽象的な幾何学的な見出し画像が気に入ったなら、彼らのモデルが「学習した」元のアーティストも気に入るかもしれません：https://leegriggs.com/xgen-rendered-with-arnold-for-maya