Google DeepMind veröffentlicht AlphaGenome Atlas: Karte aller möglichen DNA-Veränderungen
Google DeepMind Releases AlphaGenome Atlas
Das menschliche Genom besteht aus etwa 3 Milliarden Basenpaaren, doch der Großteil davon ist unerforscht. Google DeepMind hat nun den AlphaGenome Atlas vorgestellt, eine Datenbank, die die Auswirkungen aller neun Milliarden möglichen einzelnen Nukleotidvarianten vorhersagt. Der Atlas nutzt den AlphaGenome-AI-Modell und bietet einen einfachen AVI-Score, der Coding- und Non-Coding-Regionen kombiniert. Erste Anwendungen zeigen Erfolge bei seltenen Krankheiten und komplexen Merkmalen, etwa am Broad Institute und mit UK-Biobank-Daten.
Unser neuer Atlas hilft Wissenschaftlern, diese riesige Informationsmenge schnell zu durchsuchen.
- jFmDRz73
Dieser Google-Blogbeitrag ist eine destillierte Version eines DeepMind-Blogbeitrags:
https://deepmind.google/blog/alphagenome-atlas-a-predictive-...
Sie kündigen nur einen Cache an. Der Ursprung des Caches wird nicht diskutiert.
Insbesondere wird die Frage, ob man den Vorhersagen vertrauen kann, nicht angesprochen. Dafür ist, glaube ich, das Zitat vom Januar:
- John7878781
Die Leute stimmen dem zu, weil es das Präfix "Alpha______" hat. In der Zwischenzeit weiß jeder in der Genomik, dass AlphaGenome im Wesentlichen keine Verbesserungen gegenüber dem bisherigen SOTA, Borzoi, bietet …
- DoctorOetker
Kein Wort über Promotorsequenzen.
Stellen Sie sich zelluläre Aktivität als Industriegebiet vor: Es geht nicht nur darum, was man herstellen kann oder nicht, sondern auch darum, 'für welche Konzentrationen chemischer Spezies, welche Transkriptionsraten verwendet werden sollten'. Abgesehen von den diskreten Mendelschen Aspekten (wie Augenfarbe oder was auch immer) gibt es also auch eine Konsensussequenz und Abweichungen vom Konsensus. Sie erwähnen, dass der Datensatz nicht-kodierende DNA erfasst, was Promotorsequenzen implizieren sollte. Wird es möglich sein, das Atlas nach gemeinsamen Wahrscheinlichkeiten von Promotor und mutmaßlichem Zielprotein in menschlichen Genomen zu durchsuchen?
Personalisierte Medizin konnte nie glaubwürdig abheben, solange Promotorsequenzen vor der Sequenzierung herausgeschnitten wurden!
- leopoldj
Videos. [2] ist für die Wissenschaftler, um mit der Nutzung des AlphaGenome Atlas von AntiGravity zu beginnen.
- SubiculumCode
Alpha Fold hat weiterhin Einfluss auf das Gebiet der Proteinnetzwerke, aber ich höre, dass nicht jedes der Deep-Learning-Biologiemodelle von Google/DeepMind und anderen eine gleichwertige Wirkung erzielt hat oder eine so nachhaltige Relevanz in ihren jeweiligen Bereichen hatte. Einige haben schlechter abgeschnitten als andere verfügbare Modelle. Ich würde gerne mehr darüber erfahren, aber das stammt meist aus kleinen Gesprächsfetzen hier und da, persönlich und online, aber ich habe nichts Umfassendes gesehen, das ihre Auswirkungen insgesamt bewertet.
- Stevvo
Lassen Sie sich nicht von dem Kästchen abschrecken, das nach Ihrer "Zugehörigkeit" fragt. Ich habe "Keine" geschrieben, auf Senden geklickt, und es hat mich direkt zum Atlas geführt.
- asxndu
Ich liebe DeepMind wirklich, es ist wirklich darauf ausgerichtet, KI zu nutzen, um die Welt zu einem besseren Ort zu machen.
- RobotToaster
Kann dies mit einem 23andMe-Genom verwendet werden, um pathogene Mutationen zu finden?