CSV-объединитель: выравнивает несовпадающие столбцы по заголовкам прямо в браузере
CSV merger that lines up mismatched columns by header, browser-only

Бесплатный инструмент filetools для слияния CSV-файлов работает полностью локально в браузере, ничего не загружая на сервер. Он автоматически сопоставляет столбцы по именам заголовков, даже если они расположены в разном порядке, и заполняет недостающие ячейки пустыми значениями, не смещая данные. Поддерживает до 20 МБ на файл, обрабатывает поля с запятыми и переводами строк, позволяет добавлять столбец с именем исходного файла. Вопросы конфиденциальности решены: страница загружает всего 11 КБ JavaScript.
Ничего не загружается на сервер — выключите Wi-Fi после загрузки страницы, и она всё равно будет работать.